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KEK
高エネルギー加速器研究機構
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KEK IMSS 放射光科学研究施設
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構造生物学研究センター
KEK User Information
共同利用者支援システム

BL-1Aを利用する方へ

  1. 2014年10月よりより、新サンプル交換システムPAM-HCが導入されました。
    UGUISからの操作手順は今まで通りです。

  2. 実験中にBBSを閉じないでください。
    分光器の熱負荷に変化があると、セッティングが変化してしまいます。 長時間実験を行わない場合や実験終了時はハッチを閉め、SHUTTER開の状態にしてください。

  3. ビームダンプなどによる再入射後の対応
    • UGUI、UGUISのメニューバーにある[Special]メニューから[Gap]を選択する。



    • 確認のダイアログボックスが出てくるので、[OK]を押す。




BL-1Aの仕様

研究分野

タンパク質結晶構造解析

光源

真空封止型短周期アンジュレータ

光学系

分光器
16.5 m
液体窒素冷却型 Si(111) チャンネルカット結晶分光器
垂直集光ミラー
18.6 m
Rh コート SiO2 圧電バイモルフミラー
(電極数 : 16)
入射角 : 4.0 mrad
長さ600 mm x 幅 45 mm
水平集光ミラー
19.2 m
Rh / SiO2 薄膜2層圧電バイモルフミラー
(電極数 : 12)
入射角 : 4.0 mrad
長さ600 mm x 幅 45 mm

サンプル位置でのX線について

使用可能ビーム波長 : 0.96 - 1.1 Å, 2.7-3.3 Å
フォトン数 : 0.9 x 1011@ 1.1 Å
標準ビームサイズ (H x V) : 0.013 x 0.013 mm

実験ステーションの設備

X線二次元検出器 : Eiger X4M
型式 : PAD
受光面積 : 155.2 x 162.5 mm2
ピクセルサイズ : 75 x 75 µm
総ピクセル数 : 2070 x 2167
回折像のファイルサイズ : 2 MByte
読み出し速度 : 0.000003 秒
1フレームあたりのデータ収集時間 : 露光時間
試料-検出器間距離 : 60 - 450 mm
検出器の垂直方向のオフセット : 変更不可
試料吹付低温装置 : 低温窒素、ヘリウムガス吹付方式
(窒素ガス95 K ~ 300 K、ヘリウムガス30 K ~ 95K)
蛍光検出器 : Si-PINフォトダイオード

ワークステーション、データ解析ソフトについて

コンピュータ
   ワークステーション 5台 ( Linux CentOS6 )
   バックアップ用PC 2台 ( Windows8.1 Linux )

利用可能なデータ処理ソフトウェア : HKL2000, iMosflm, XDS

発表論文

Improvement of an Automated Protein Crystal Exchange System PAM for High-throughput Data Collection
Masahiko Hiraki, Yusuke Yamada, Leonard M. G. Chavas, Soichi Wakatsuki, Naohiro Matsugaki
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3795550/

Data Management System at the Photon Factory Macromolecular Crystallography Beamline
Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Leonard M. G. Chavas, Masahiko Hiraki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Journal of Physics: Conference Series ; 425, 012017 (2013)
http://iopscience.iop.org/1742-6596/425/1/012017

Current stats and future prospects of an automated sample exchange system PAM for protein crystallography
Masahiko Hiraki, Yusuke Yamada, Leonard M. G. Chavas, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Journal of Physics: Conference Series ; 425, 012014 (2013)
http://iopscience.iop.org/1742-6596/425/1/012014

Fully Automated Data Collection Using PAM and the Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes
Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M. G. Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Mamoru Suzuki, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, and Isao Tanaka, AIP Conference Proceedings, 1234, 673 (2010)
http://proceedings.aip.org/resource/2/apcpcs/1234/1/673_1

High-throughput operation of sample-exchange robots with double tongs at the Photon Factory beamlines
Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Nobuo pHonda, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Yurii Gaponov and Soichi Wakatsuki, Journal of Synchrotron Radiation, Vol.15, 300-303 (2008)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18421164

Implementation of remote monitoring and diffraction evaluation systems at the Photon Factory macromolecular crystallography beamlines
Yusuke Yamada, Nobuo pHonda, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Masahiko Hiraki, Soichi Wakatsuki, Journal of Synchrotron Radiation, Vol.15, 296-299 (2008)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18421163

Automated Sample Exchange Robots for the Structural Biology Beam Lines at the Photon Factory
Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Yurii Gaponov, and Soichi Wakatsuki, AIP Conference Proceedings, 879, 1924 (2007)
http://proceedings.aip.org/resource/2/apcpcs/879/1/1924_1

フォトンファクトリー構造生物ビームラインにおける自動化に向けた取り組み
五十嵐教之, 平木雅彦, 松垣直宏, 山田悠介, 若槻壮市, 日本結晶学会誌, Vol.49(6), 359-363 (2007)
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jcrsj1959/49/6/49_6_359/_article/-char/ja/

連絡先

Naohiro Matsugaki (KEK-PF)
Phone : +81-29-864-5640
PHS : +81-29-864-5200 (ext : 4340)
FAX : +81-29-864-2801
E-mail : naohiro.matsugakikek.jp


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